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Università degli Studi di Verona – Facoltà di Scienze MM. FF. e NN.
Corso di Laurea Triennale in Biotecnologie a.a. 2011-2012 Corso di Microbiologia Generale ● Titolare: Prof. Giovanni Vallini
IL SILLABO
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li ap
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on
basta
no
!
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IL SILLABO
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IL TESTO DI RIFERIMENTO
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Filogenesi e Diversità Microbica
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Filogenesi e Diversità Microbica
2Fe2+ + 2H+ → 2H2 + 2Fe3+
UV
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Filogenesi e Diversità Microbica
In the late 1970s, Prof. Carl R. Woese, with
the University of Illinois at Urbana, Illinois –
USA. spearheaded a study of evolutionary
relationships among prokaryotes. Instead
of physical characters, he relied on RNA
sequences to determine how closely
related these microbes were.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Mitochondria and the respiratory
bacterium, Agrobacterium, are
derived from a common
ancestor; likewise, chloroplast
and the cyanobacterium,
Synechococcus, arise from a
common origin. This is good
evidence for the idea of
evolutionary endosymbiosis, i.e.,
that the origin of eucaryotic
mitochondria and chloroplasts is
in procaryotic cells that were
either captured by, or which
invaded, eucaryotic cells and
subsequently entered into a
symbiotic association with one
cell living inside of the other.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Structure of a phospholipid bilayer, typically recurring in Bacteria and Eukarya
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Filogenesi e Diversità Microbica
(a) The ester linkage as found in the lipids of Bacteria and Eukarya.
(b) The ether linkage of lipids from Archaea. (c) Isoprene, the
parent structure of the hydrophobic side chains (R) of
archaeal lipids. By contrast, in lipids of Bacteria and Eukarya,
R are fatty acids.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Major lipids of Archaea and the structure of archaeal membranes. (c, d) Membrane
structure in Archaea. (c) Lipid bilayer. (d) Lipid monolayer
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Filogenesi e Diversità Microbica
Structure of the repeating units of peptidoglycan occurring in Bacteria
and cell wall pseudomurein of Archaea
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Filogenesi e Diversità Microbica
Schematic side view of cell wall profiles from different archaea.
Pseudoperiplasmic space is shown in blue.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Schematic of bacterial cell walls. Gram-positive bacteria have a thick, amorphous,
multilayered coat of peptidoglycan, teichonic and lipoteichonic acid as their cell
wall and in some cases have surface-layer (S-layer) glycoproteins as the outermost
layer above the peptidoglycan (also known as murein), for example, Gram-
negative bacteria have an outer asymmetric bilayer membrane composed of two
leaflets, an outer one containing lipopolysaccharides (LPSs), and an inner one
containing mainly phospholipids, a gel-like periplasm containing peptidoglycan
and the cytoplasmic membrane. CM, cytoplasmic membrane; SL, S-layer.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Action of diphtheria toxin.
The toxin-binding (B)
portion attaches to the
cell membrane, and the
complete molecule enters
the cell. In the cell, the A
subunit dissociates and
catalyzes a reaction that
ADP-ribosylates and thus
inactivates elongation
factor 2 (EF-2). This factor is
essential for ribosomal
reactions at the acceptor
and donor sites, which
transfer triplet code from
messenger RNA (mRNA) to
amino acid sequences via
transfer RNA (tRNA).
Inactivation of EF-2 stops
building of the
polypeptide chain.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Demonstration of ribotyping. DNA is
isolated from a cultured isolate, restricted
and size separated in an agarose gel.
The gel is then hybridized with labeled
rRNA probe, which binds to fragments
containing copies of the rRNA operon.
Following probe detection, fragments
with bound probe are visualised, forming
a characteristic RFLP.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Demonstration of restriction fragment length polymorphism (RFLP). The DNA
fragment is restricted into 3 pieces (1, 2 and 3) by a restriction enzyme. The
restricted DNA is then inserted into a well in an agarose gel and the
fragments are separated by electrophoresis. The separation is based on
fragment size, with the smallest fragments migrating further into the gel. This
pattern, termed RFLP, represents a characteristic fingerprint of this DNA
fragment.
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Filogenesi e Diversità Microbica
Dendrogram concerning Achromobacter sp. isolates. based on cluster
analysis of EcoRI ribotype patterns obtained by automated ribotyping
with the RiboPrinter microbial characterization system.
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MAIN INTERNATIONAL CULTURE COLLECTIONS OF MICROORGANISMS
Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen
American Type Culture Collection