+ All Categories
Home > Documents > Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer...

Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer...

Date post: 16-Feb-2019
Category:
Upload: vuduong
View: 227 times
Download: 0 times
Share this document with a friend
19
Caserta 31 maggio 2008 Cristina Massai Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Università di Firenze Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare direttamente da campione clinico in pazienti con terapia antibiotica in atto
Transcript
Page 1: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Caserta 31 maggio 2008

Cristina MassaiClinica Pediatrica IIOspedale Meyer

Università di Firenze

Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare direttamente da campione clinico in pazienti con terapia antibiotica in atto

Page 2: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

tempo dopo la somministrazione dell’antibiotico[ore]

tempo di sterilizzazione del liquor cefalo-rachidianodopo somministrazione di antibiotico per via parenterale

Kanegaye JT et al. Pediatrics 2001; 108: 1169-1174

2418126

coltura positiva coltura negativa

Neisseriameningitidis

Streptococcuspneumoniae

Streptococcusgruppo B

Dipartimento di PediatriaUniversità di Firenze

Page 3: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Coltura PCR

Richiede

non terapia antibiotica precedente

OK se terapia antibiotica precedente

germe vivo germe anche morto

terreni di coltura adeguati anche in fisiologicaanche campione “già usato”

trasporto rapido a t°C ambiente anche 48h

laboratorio microbiologia tecniche e macchinari semplici

Page 4: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Si estrae il DNA

Si parte da sangue intero

Primers per:

9V1423F

6B

Nucleotidi EnzimiDNA estratto

altri

Sierotipizzazione: PCR- Multiplex Sequenziale

Page 5: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Diagnosi e sierotipizzazione mediante PCR multiplex sequenziale di infezioni

pneumococciche in età pediatrica(BP + meningiti/sepsi)

RT-PCR n: 22/98Coltura n: 4/98

05

101520253035

%dicasi positivi

25/98hanno fattobreve terapia antibioticaprima del ricovero

0

5

10

15

20

25

30

35

40

RT-PCR n: 9/25Coltura n: 0/25

%di casipositivi

Paz. con pregressa Paz. con pregressa terapia terapia antibioticaantibiotica

Page 6: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Distribuzione dei sierotipi isolati in corso di malattie invasive del bambino

Sierotipo contenuto nel vaccino eptavalente

3

2

1

0

polmonite meningitesepsi

artrite

Esame colturaleEsame colturale

Azzari C, Moriondo M, Massai C, Resti M.J Med Microbiol 2008

Page 7: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Distribuzione dei sierotipi isolati in corso di malattie invasive del bambino

Sierotipo contenuto nel vaccino eptavalenteAzzari C, Moriondo M, Massai C, Resti M.J Med Microbiol 2008

3

2

1

0

polmonite meningitesepsi

artrite

6 8 19F 1 3 4 12 14 18 18C 19A ? ? 4 6 9V/A 23F 22F ?

Esame PCREsame PCR

Page 8: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Parliamo di costi……

Un apparecchio per real-time PCR

Un apparecchio per PCR standard

25.000 €

5.000 €

Un test di diagnosi

Un test di sierotipizzazione

5 €

12 €

La sola sierotipizzazione da coltura costa 45 €

(gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV)

Page 9: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Progetto sorveglianza nazionale delle infezioni invasiveMeningococco, pneumococco, Haemophilus

Miglioramento della possibilità di diagnosi mediante biologia molecolare

Sensibilizzazione al problema

Centralizzazione presso l’Ospedale Meyer dei campioni per diagnosi

Diffusione delle metodiche diagnostiche molecolaria tutte le regioni

I fase

II fase

Page 10: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Progetto Malattie InvasiveLaboratorio Immunologia Meyer

Viale Pieraccini 2450139 FIRENZE

[email protected]

L’esecuzione del test è gratuita

La risposta viene inviata via FAX all’ospedale richiedente entro 48 ore dall’arrivo

[email protected]

[email protected]

Chiamare TRACO 10 - Tel. 803-868

La spedizione del campione ègratuita (a carico del destinatario) Indicare “PORTO ASSEGNATO”

Page 11: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Grazie per l’attenzione!!!!

Page 12: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza
Page 13: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza
Page 14: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

IPD in bambini italiani valutata con colturaIPD in bambini italiani valutata con coltura

D’Ancona F. Vaccine 2005Italian PNC-Euro Working group

0

10

20

30

40

50

60X 100.000

piemontepuglia

116

< 2 anni

11,511,5

Azzari Resti 2007

Provincia di Firenze

Incidenza di infezioni invasive Incidenza di infezioni invasive pneumococcichepneumococciche (IPD)(IPD)valutata con PCR o mediante colturavalutata con PCR o mediante coltura

Page 15: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Casi x 100.000

Incidenza di IPDIncidenza di IPDnella popolazione pediatrica fiorentina nella popolazione pediatrica fiorentina

valutata mediante colturavalutata mediante coltura

0

10

20

30

40

50

60

anni<1

11,2

<2

11,5

<5

4,7

<14

3,6

Page 16: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Casi x 100.000

anni

Incidenza di IPDIncidenza di IPDnella popolazione pediatrica fiorentina nella popolazione pediatrica fiorentina

valutata mediante PCRvalutata mediante PCR

0

10

20

30

40

50

60

<1

55,8

<2

51,8

<5

35,1

<14

19,9

Page 17: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

RT-PCR nella diagnosi di infezioni invasive da pneumococco

0

5

10

15

20

25

Broncopolmoniti n: 82Broncopolmoniti n: 82

positivi RT-PCR n: 18

positivi Coltura n: 2

%

0

20

40

60

80

100

positivi RT-PCR n: 11

positivi Coltura n: 5

Meningiti / sepsi n: 11Meningiti / sepsi n: 11PneumoPneumo--MeningoMeningo%

Page 18: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Progetto Malattie Invasive

Page 19: Diagnosi e tipizzazione di IPD in biologia molecolare ... · Clinica Pediatrica II Ospedale Meyer Universitàdi Firenze ... (gli stessi che usiamo per HCV, HIV, CMV) Progetto sorveglianza

Real-Time PCR per PNEUMOCOCCO: primer per gene PLY (pneumolisina) conferma primer cps-A (PCR in gel di agarosio)

4 campioni

Entitàdi fluorescenza

Cicli di amplificazionenel tempo

L’amplificazione di un prodotto significa presenza di DNA specificoSi evidenzia come incremento di fluorescenza


Recommended