Simona Rossi

Università di Ferrara

SRossi@mdanderson.org

Quanto l’ITAS è stato importante per me…e non solo

Matematica ed informatica all’UniversitàForma mentisEconomia come fonte di organizzazioneMarchetti Nicola (Diploma Indirizzo

Programmatori ’97, Laurea in Ingegneria Elettronica, Ricercatore)

Pinotti Mirko (Diploma Indirizzo Biologico, Laurea in Biologia, Ricercatore presso l’Università di Ferrara)

Importanza della Bioinformatica

Dati genomici, funzionali, databases pubblici e privati

Dati clinici

Dati relativi a diverse forme di cancro e malattie rare

Gli studi Bioinformatici stanno emergendo come importanti strumenti per identificare associazioni

fra diversi tipi e fonti di dati

ncRNA profiling, l’uso di dispositivi quali i microarrays di espressione, risorse pubbliche quali il

Mappaggio genico, espressione, databases funzionali, E algoritmi di predizione hanno permesso l’identificazione

Di specifiche signatures associate condiagnosi, prognosi e risposta al trattamento dei tumori

umani.

Microarrays

  C1 C2 T1 T2

gene1 34 89 55 89

gene2 22 888 44 77

gene3 345 78 34 896

gene4 212 66 333 234

gene5 23 7 567 564

….. …. ….. …. ….

Misurare la qualità di DNA microarrays

Pseudo-images Normalized unscaled standard errors (NUSE).

Relative log expression (RLE).Percentage of PM > MM.

Mascellani et al, 2007. UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia

TOM

Rossi et al, 2005. UniFE, Lab Prof. Stefano Volinia

GebbaLab

Progetto Regionale Emilia Romagna: UniFE, IOR, NSI

Lab Prof. George Calin

MicroRNAs• I microRNAs sono piccole molecole di

RNA a singolo filamento di 20-22 nucleotidi che svolgono diverse funzioni

• Ciascun miRNA si lega al complesso proteico RISC e lo guida verso l'mRNA target.

• Negli animali, si è visto che il complesso costituito da RISC e miRNA si associa per complementarietà imperfetta alla 3'UTR dell'mRNA target, causando in questo modo il blocco della traduzione di quell'mRNA.Si è visto che un mRNA può essere riconosciuto e legato da diversi complessi miRNA-RISC, inoltre ciascun tipo di complesso miRNA-RISC può legarsi ad mRNA target diversi.Studi attuali stanno dimostrando che in alcuni tipi di cancro i livelli di alcuni miRNAs sono bassi o alti dando origine a miRNA oncosoppressori o tumorali.

Tiziano Terzani

…”cercate una vita che vi assomigli”

Da: La fine è il mio inizio

Domande??????????...sì dai!!!!!!