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Definizioni:
•genoma
•trascrittoma
•proteoma
Paradosso del valore C
• Eccesso di DNA rispetto alla complessità
• Variazioni di valore C per complessità simili
Struttura del genoma eucariotico
•Sequenze ripetute
•DNA non
codificanti
•Geni interrotti
Uniche(1-10 volte)circa 40%
Mediamente ripetute(da centinaia a migliaiadi volte)40-50%
Altamente ripetute(da decine di migliaiaa milioni di volte)5-10%
Maggior parte dei geni
Alcune sequenze regolative
Alcune sequenze a funzione speciale(centromeri, origini, etc.)
intersperse
in tandemGeni reiterati(rRNA, 5S RNA, tRNA, Istoni etc.)
DNA satellitisequenze semplici
Sequenze ripetute nel genoma umano
geni per: rRNA (300)tRNA (1300)5S RNA (2000)istoni (20)
sequenze ripetute interspersesequenza Alu: 300 nt (x 1.000.000)
sequenze semplici o satelliti: 2-10 nt (x 2-100 copie in tandem x 1-100 blocchi interspersi)
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
•Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici
•Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006
Gene per il collagene 12 di pollo
•Esoni: sequenze rappresentate nell’RNA maturo
•Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S.p.A. Copyright © 2006