I giornata della ricerca Dipartimento di Biomedicina e
Prevenzione13 maggio 2013
I microRNA come modello I microRNA come modello di regolazione post-di regolazione post-
trascrizionale nei tumori trascrizionale nei tumori solidisolidi
Silvia Anna Ciafrè Maria Giulia Farace Barbara Fazi Silvia Galardi
Nome Cognome, qualifica: Silvia Anna Ciafrè, P.A. SSD di afferenza: BIO 13 (Biologia Applicata)Patologie di maggior interesse:
glioblastoma
Altre Patologie di interesse: adenocarcinoma prostatico, neuroblastomaArgomenti generali di interesse:
regolazione post-trascrizionale dell’espressione genica, microRNA, lncRNA, cellule “staminali” cancerose, cellule staminali neurali, biomarcatori
Metodiche di laboratorio: PCR, RT-PCR, RQ-PCR, WB, NB, IF, ChIP, EMSA, saggi in vitro di proliferazione, migrazione, invasione, angiogenesi, modelli murini di crescita tumorale sottocutanea
Collaborazioni (ambito): •Proff. G. Maira e A. Mangiola, Istituto di Neurochirurgia, Università Cattolica del Sacro Cuore di Roma, (glioblastomi)
•Prof. G. Pelicci, IFOM-IEO Milano, (glioblastoma e CLIC1)•Dott. G. Finocchiaro, Istituto neurologico C. Besta, Milano (cellule staminali neurali di topo e cellule “staminali” di glioblastoma)
•Dott. S. Nasi, CNR-IBPM, Roma (Omomyc e cellule “staminali” di glioblastoma)
•Dr. J. Benard, IGR Villejuif, Francia (neuroblastoma e microRNA)• Dr. I. Groisman, CNRS FRE 3377 "Epigénétique et Cancer“, Gif-sur-Yvette, Francia (regolazione post-trascrizionale di p27 nel cancro)
Da: Nana-Sinkam , Croce Non-coding RNAs in cancer initiation and progression and as novel biomarkers Mol.Oncol. 5 (6) 2011 483 - 491
Diverse classi di RNA non Diverse classi di RNA non codificanti e loro codificanti e loro contributo alla contributo alla
regolazione regolazione dell’espressione genica dell’espressione genica
nel cancronel cancro
Prima analisi completa di Prima analisi completa di espressione dei microRNA in espressione dei microRNA in
campioni di glioblastomi umanicampioni di glioblastomi umani
miR-221 e miR-222
Definizione dei meccanismi di azione e Definizione dei meccanismi di azione e dei fattori che regolano di miR-221/222 dei fattori che regolano di miR-221/222 nel glioblastoma e in altri tumori solidi nel glioblastoma e in altri tumori solidi umaniumani
Studio del profilo di espressione di Studio del profilo di espressione di mRNA ed RNA non codificanti mRNA ed RNA non codificanti
(SAGE) in campioni di glioblastoma (SAGE) in campioni di glioblastoma umanoumano
Ricerca di una “molecular signature” in grado di distinguere tessuti di pazienti lungo-sopravviventi da quelli di pazienti a sopravvivenza breve
Ricerca di RNA, codificanti e non, la cui espressione sia modulata, oltre che nel tessuto tumorale, anche nelle zone peritumorali, comunemente sede di recidiva, e probabile luogo di fenomeni precoci di trasformazione Analisi del significato funzionale delle molecole così identificate, in modelli in vitro di linee cellulari e cellule “staminali” di glioblastoma
• Capacità di migrazione, invasione, adesione
Caratterizzazione degli effetti molecolari e Caratterizzazione degli effetti molecolari e funzionali di un dominante negativo di c-funzionali di un dominante negativo di c-
myc in cellule staminali cancerose di myc in cellule staminali cancerose di glioblastomaglioblastoma
BT168
-dox +dox
Self-renewal
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60000
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180000
200000
0 gg 1 gg 2 gg 3gg 4 gg
BT 168omomyc -DoxBT 168omomyc+ DoxBT 168GFP -DoxBT 168GFP +Dox
Proliferazione
• Profilo di espressione dei microRNA e analisi del coinvolgimento dei miRNA modulati negli effetti funzionali • Profilo di espressione dei lncRNA e studio dei meccanismi regolativi
Differenziamento